Το χλώριο είναι ιδιαίτερα άφθονο στους γαστρικούς χυμούς, ιδιαίτερα στο υδροχλωρικό οξύ, το οποίο παίζει ουσιαστικό ρόλο στην πέψη των πρωτεϊνών και στην άμυνα έναντι των μικροβίων που εισάγονται με την τροφή.
Στον οργανισμό, καθώς και στα τρόφιμα, το χλώριο υπάρχει κυρίως ως χλωριούχο νάτριο (κανονικό επιτραπέζιο αλάτι) και κάλιο. Η απορρόφηση συμβαίνει στο πρώτο μέρος του λεπτού εντέρου, μέσω ανταλλαγής με όξινα ανθρακικά άλατα. τις οδούς ούρων και κοπράνων, αλλά και μέσω του ιδρώτα.
Μόλις απορροφηθεί, επεμβαίνει στη ρύθμιση της ισορροπίας οξέος-βάσης, οσμωτικής πίεσης και ισορροπίας νερού (ρυθμίζει την κατανομή υγρών εντός και εκτός των κυττάρων και μαζί με αυτόν τον όγκο, δηλαδή τον όγκο του αίματος που υπάρχει στο "σώμα"). διευκολύνει επίσης τη μεταφορά διοξειδίου του άνθρακα από τα ερυθρά αιμοσφαίρια.
.
Τα καρυκευμένα τρόφιμα, τα τυριά, τα αλλαντικά, το νερό και τα αλμυρά αρτοσκευάσματα είναι ιδιαίτερα πλούσια σε αυτό.
(λόγω της μαζικής αποβολής των γαστρικών υγρών), διάρροια (λόγω ανεπαρκούς εντερικής ανταλλαγής με διττανθρακικά) ή υπερβολική εφίδρωση.Μια χρόνια υπερβολική δόση χλωρίου, αφού συνοδεύεται από υπερβολική πρόσληψη νατρίου, ευνοεί την εμφάνιση της υπέρτασης.
