Υπάρχουν συγκεκριμένες μεταβολικές οδοί που μπορούν να καθοριστούν για να προσδιοριστεί η κατασκευή συγκεκριμένων μορίων.
Οδός σχιχιμικού οξέος: δευτερεύουσα μεταβολική οδός που έχει ως πρόδρομο το σκιιμικό οξύ, ένα μόριο που περιέχει μέσα του αυτά τα δομικά και χημικά χαρακτηριστικά που μπορούν να βρεθούν στους δευτερογενείς μεταβολίτες που προέρχονται από αυτό.
Το μόριο του σχιχιμικού οξέος αποτελείται από: 6μελή δακτύλιο, 1 καρβοξυλική ομάδα και 3 υδροξυλομάδες. Αυτή η ίδια μοριακή αρχιτεκτονική μπορεί να βρεθεί στους δευτερογενείς μεταβολίτες που προέρχονται από αυτό και οι οποίοι στην πραγματικότητα ονομάζονται παράγωγα το οξύ. Το σκιχιμικό οξύ προέρχεται από την ένωση δύο ενδιαμέσων δύο διαφορετικών πρωτογενών μεταβολικών οδών:
ερυθροσίου-4-φωσφορικό (3C): ενδιάμεσο της σκοτεινής φάσης της φωτοσύνθεσης, αναβολική μεταβολική διαδικασία.
φωσφονολοπυρροϊκό οξύ (3C): ενδιάμεσο της γλυκόλυσης, καταβολική μεταβολική διαδικασία.
Επομένως, ερυθρο-4-φωσφορικό + φωσφονολοπυρροϊκό οξύ = σκιχιμικό οξύ: ο πρώτος πρόδρομος των δευτερογενών μεταβολικών οδών.
Το κύτταρο συνθέτει το σχιχημικό οξύ όταν οι ανάγκες είναι τέτοιες ώστε να το επιτρέπουν ή όταν οι ποσότητες των δύο κύριων ενδιάμεσων είναι τόσο πολλές και μπορούν να συσσωρευτούν. Αυτό συμβαίνει όταν υπάρχει αρκετή ποσότητα ΑΤΡ στο κύτταρο και αυτό επιβραδύνει τις αντιδράσεις του πρωτοπαθούς καταβολισμού και αναβολισμού.
Διαδρομή μηλονικού και μεβαλονικού οξέος: και οι δύο πρόδρομοι προέρχονται από ένα μόριο Acetyl CoA, επομένως και οι δύο αποτελούν ένα μονοπάτι: την οξεική οδό. Το Acetyl CoA είναι ένα μόριο σύνδεσης μεταξύ της γλυκόλυσης και του κύκλου Krebs και ως εκ τούτου μπορούμε να το ορίσουμε ως ενδιάμεσο του πρωτογενής μεταβολισμός του κυττάρου.
Οξική ομάδα (ομάδα με δύο άτομα άνθρακα) + CoA (συνένζυμο Α) = Acetyl CoA: μόριο που ανήκει στον πρωτογενή μεταβολισμό, το οποίο χρησιμοποιείται ως βιολογικό δομικό στοιχείο στην κατασκευή δευτερογενών μεταβολιτών.
Στη συνέχεια, η οδός οξικού διακρίνεται από το μονοπάτι του μηλονικού οξέος και το μονοπάτι του μεβαλονικού οξέος. Το συνένζυμο Α δρα ως μεταφορά των δύο ανθρακούχων μονάδων από το κυτταρόπλασμα στο μιτοχόνδριο του κυττάρου, όπου λαμβάνει χώρα ο κύκλος του Krebs. Αντ 'αυτού, ο άνθρακας μεταφέρεται αλλού σε περίπτωση πλεονάσματος ενέργειας και μπορεί να αποτελέσει τους πιο ποικίλους δευτερογενείς μεταβολίτες · αυτοί έχουν ως κοινό χαρακτηριστικό έναν άρτιο αριθμό ατόμων άνθρακα, συμπεριλαμβανομένου του μηλονικού οξέος (C4) και του μεβαλονικού (C6).
Τα μεταβολικά μονοπάτια του σχιχιμικού οξέος και του οξικού έχουν επομένως μια ακριβή μοριακή αρχιτεκτονική, η οποία μας επιτρέπει να εντοπίζουμε εύκολα τα δευτερεύοντα παράγωγά τους. Για ο αλκαλοειδή, που έχουν διαφοροποιημένη αρχιτεκτονική, η αναγνώριση του προδρόμου δεν είναι τόσο εύκολη · με άλλα λόγια, δεν είναι τόσο εύκολο να ταξινομηθούν οι μεμονωμένες κατηγορίες αλκαλοειδών, εντοπίζοντας το καθένα σε έναν μόνο πρόδρομο. Τα αλκαλοειδή, στην πραγματικότητα, έχουν περισσότερα από ένα πρόδρομος, δεδομένου ότι προέρχονται από αμινοξέα (πρωτεύουσες ενώσεις αζώτου, που το κύτταρο χρησιμοποιεί για την παραγωγή δευτερογενών μορίων αζώτου). Οι δευτερογενείς μεταβολίτες αζώτου είναι κυρίως αλκαλοειδή, αλλά υπάρχουν και άλλα μόρια με χαμηλότερο προφίλ υγείας από τα δικά τους, όπως κυανογόνα γλυκοζίτες (που περιέχονται σε πικρά αμύγδαλα) και β-κυανοί (χρωστικές ουσίες) Τα αμινοξέα είναι αζωτούχες ενώσεις διαφοροποιημένες μεταξύ τους και αυτή η ποικιλομορφία αντικατοπτρίζει τη διαφοροποίηση των άμεσων παραγώγων τους, που είναι τα αλκαλοειδή.
Το μόνο χημικό στοιχείο που ενώνει τις διαφορετικές κατηγορίες αλκαλοειδών είναι ένα άτομο αζώτου κλεισμένο σε έναν ετεροκυκλικό δακτύλιο ή τουλάχιστον ένα άτομο αζώτου με ένα ελεύθερο διπλό ηλεκτρόνιο που τους δίνει βασικές ιδιότητες · την ίδια βασική αντιδραστικότητα που μας επιτρέπει να εξάγουμε τα μεμονωμένα αλκαλοειδή με μετατόπιση.
Μπορούμε να το συνοψίσουμε λέγοντας αυτό το μονοπάτι των υδατανθράκων είναι το μεταβολικό μονοπάτι που βασίζεται στη σύνθεση όλων των δευτερογενών μεταβολιτών, επομένως περιλαμβάνει όλες τις μεταβολικές οδούς που είχαμε δει προηγουμένως:
- η οξική ουσία είναι το προϊόν της πλήρους κατεδάφισης του μορίου γλυκόζης.
- τα αμινοξέα προέρχονται από μεταβολικές διαδικασίες αποικοδόμησης υδατανθράκων.
- το σκιχιμικό οξύ είναι πρόδρομος δευτερογενών μεταβολιτών, αλλά και αρωματικών αμινοξέων (φαινυλαλανίνη, τρυπτοφάνη και τυροσίνη).
-ο γλυκοζίτης είναι ένας δευτερεύων μεταβολίτης που αποτελείται από ένα σάκχαρο συν μια μονάδα χωρίς ζάχαρη, που ονομάζεται αγλυκόνη, ο οποίος προέρχεται πιθανώς από μία από τις μεταβολικές οδούς που συνοψίζονται.
Όλα τα βιογενετικά δομικά στοιχεία από τα οποία προέρχονται οι δευτερογενείς μεταβολίτες προέρχονται είτε από τον καταβολισμό των υδατανθράκων είτε από τον αναβολισμό τους. Αυτά τα σάκχαρα είναι οι ίδιες μονάδες σακχάρου που όταν συνδεθούν με την αγλυκόνη αποτελούν τις γλυκοσίδες.
Η μεταβολική οδός του οξικού διαιρείται σε ένα πυκνό βιογενετικό δέντρο, που περιέχει όλα τα ονόματα των δευτερογενών μεταβολιτών στους οποίους δημιουργείται. Διαφορετικό, ανάλογα με τις ανάγκες του ίδιου του κυττάρου:
- Κύκλος Krebs με τελική παραγωγή ATP (πρωτογενής μεταβολισμός).
- β-οξείδωση και σύνθεση λιπαρών οξέων (πρωτογενής μεταβολισμός).
- Σύνθεση μηλονικού ή μηλονικού οξέος (4C), που προέρχεται από την ένωση δύο μορίων οξικού οξέος, και μεβαλονικού ή μεβαλονικού οξέος (6C) που προκύπτει από την ένωση τριών μορίων οξικού. Το κύτταρο χρησιμοποιεί αυτά τα δύο μόρια με άρτιο αριθμό ατόμων άνθρακα για να χτίσει διαφορετικές μοριακές κατηγορίες, που αποτελούνται από γραμμικές αλυσίδες μονάδων υδρογονανθράκων, όπως: λιπαρά οξέα - που χρησιμοποιούνται με τη σειρά τους για την παραγωγή γλυκεριδίων και κεριών - τερπενοειδή, ανθρακινόνες και στεροειδή.
Άλλα άρθρα με θέμα "Βιογένεση και χαρακτηριστικά των δραστικών συστατικών"
- Πρωτογενής μεταβολισμός και δευτερογενής μεταβολισμός ενός φυτού
- Φαρμακογνωσία
- Μεταβολική οδός του σκιχιμικού οξέος