Η αιτιοπαθογένεση ορίζεται ως η ανάλυση των αιτίων και της ανάπτυξης μιας παθολογίας ή μιας παθολογικής κατάστασης. Ο όρος προέρχεται από την "ένωση" αιτιολογίας "και" παθογένειας ", οι οποίες στον ιατρικό τομέα υποδεικνύουν, αντίστοιχα, τους αιτιολογικούς παράγοντες (αιτιολογία) και ο μηχανισμός έναρξης και επακόλουθης ανάπτυξης μιας παθολογικής διαδικασίας (παθογένεια).
Η αιτιοπαθογένεση μπορεί να είναι σίγουρη (επακριβώς προσδιορίσιμη), πολυπαραγοντική (που οφείλεται σε διάφορους παράγοντες), αβέβαιη, άγνωστη ή παρεξηγημένη. Οι περισσότερες από τις πιο κοινές ασθένειες αναγνωρίζουν μια "πολυπαραγοντική αιτιοπαθογένεση, αφού η προέλευση και η ανάπτυξη οφείλονται συχνά στην" αλληλεπίδραση γενετικών παραγόντων ( εξοικείωση, κληρονομικότητα, μικρές μεταλλάξεις κ.λπ.) με το πολύ σημαντικό περιβαλλοντικό συστατικό (διατροφή, σωματική δραστηριότητα, σωματικό βάρος, συνήθεια καπνίσματος, άγχος, κατανάλωση αλκοόλ, ναρκωτικά, διάφορα είδη κατάχρησης κ.λπ.). Η σημασία αυτών των παραγόντων συμπεριφοράς στην αιτιοπαθογένεση διαφόρων ασθενειών υπογραμμίζεται από το γεγονός ότι η έκφρασή τους σε ομόζυγα δίδυμα (επομένως με την ίδια γενετική κληρονομιά) μπορεί επίσης να ποικίλει σημαντικά.